Le bateau a quitté Bristol pour se diriger vers la mythique cité de Guyanacapac. Cela risque d’être un très long et périlleux voyage. D’ailleurs, la tension monte, surtout entre Lady Vivian Hastings et Long John Silver. Il semblerait d’ailleurs que ce soit vraiment lui le chef à bord. Vivian doit aussi cacher sa grossesse. Sa servante Elsie trouve une preuve qu’il y a bien des pirates à bord et alors qu’elle est sur le point de montrer cela, elle meurt écrasée par des tonneaux. Le jeune Jack, bien qu’il ait arrimé les tonneaux  comme il faut, sera fouetté à mort jusqu’à ce qu’il avoue malgré les suppliques du docteur Livesey.
En attendant, à bord, le ton monte. A l’extérieur, une tempête se prépare…